O distrito de São Francisco Xavier está localizada no município de São José dos Campos-SP, na Serra da Mantiqueira, entre o município de Montairo Labato-SP e o distrito de Monte Verde-MG.
São Francisco Xavier está na divisa de Estado em entre São Paulo e Minas Gerais.
Sistema Ayrton Senna-Carvalho Pinto/SP-070 até São José dos Campos e seguir pela SP-050 até Monteiro Lobato.
( Em São José dos Campos, seguir as placas de Alto da Ponte / São Francisco Xavier.
Depois pegar a SJC-150 - Estrada Vereador Pedro David , de Monteiro Lobato a São Francisco Xavier.